Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf5P56477 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irf5P56477 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf5P56477 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf5P56477 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf5P56477 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf5P56477 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms