Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GferP56213 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GferP56213 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GferP56213 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GferP56213 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GferP56213 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GferP56213 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GferP56213 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GferP56213 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GferP56213 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GferP56213 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GferP56213 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GferP56213 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms