Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sh3bp1P55194 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sh3bp1P55194 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sh3bp1P55194 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms