Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp8bP55105 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp8bP55105 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms