Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23bP54728 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rad23bP54728 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms