Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacnb3P54285 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacnb3P54285 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacnb3P54285 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms