Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apobec1P51908 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apobec1P51908 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms