Protein–RNA interactions for Protein: P51865

Tdgf1, Teratocarcinoma-derived growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdgf1P51865 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tdgf1P51865 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tdgf1P51865 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms