Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa8P50706 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Defa8P50706 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa8P50706 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms