Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FanccP50652 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FanccP50652 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanccP50652 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanccP50652 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FanccP50652 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanccP50652 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FanccP50652 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FanccP50652 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FanccP50652 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FanccP50652 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FanccP50652 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FanccP50652 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FanccP50652 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FanccP50652 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FanccP50652 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FanccP50652 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FanccP50652 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FanccP50652 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FanccP50652 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FanccP50652 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FanccP50652 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanccP50652 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanccP50652 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FanccP50652 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FanccP50652 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FanccP50652 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms