Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
FmodP50608 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FmodP50608 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FmodP50608 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FmodP50608 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FmodP50608 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms