Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chrna7P49582 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrna7P49582 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms