Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brca1P48754 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brca1P48754 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brca1P48754 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brca1P48754 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brca1P48754 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms