Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Edn3P48299 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Edn3P48299 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Edn3P48299 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Edn3P48299 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Edn3P48299 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms