Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VdrP48281 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VdrP48281 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VdrP48281 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
VdrP48281 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
VdrP48281 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VdrP48281 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VdrP48281 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VdrP48281 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VdrP48281 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VdrP48281 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
VdrP48281 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VdrP48281 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms