Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab11bP46638 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rab11bP46638 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms