Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NodalP43021 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NodalP43021 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NodalP43021 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NodalP43021 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NodalP43021 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NodalP43021 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NodalP43021 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NodalP43021 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NodalP43021 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NodalP43021 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NodalP43021 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NodalP43021 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NodalP43021 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NodalP43021 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NodalP43021 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NodalP43021 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms