Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sept1P42209 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept1P42209 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sept1P42209 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sept1P42209 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept1P42209 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sept1P42209 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms