Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf9P41274 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf9P41274 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf9P41274 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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