Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ThpoP40226 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ThpoP40226 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ThpoP40226 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ThpoP40226 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms