Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col18a1P39061 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col18a1P39061 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col18a1P39061 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms