Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1aP36536 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1aP36536 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1aP36536 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1aP36536 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sar1aP36536 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sar1aP36536 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sar1aP36536 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms