Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Grin2aP35436 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Grin2aP35436 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Grin2aP35436 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms