Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sftpa1P35242 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sftpa1P35242 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sftpa1P35242 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms