Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ptk2P34152 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptk2P34152 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms