Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2aP34056 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2aP34056 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms