Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pola1P33609 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pola1P33609 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pola1P33609 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms