Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Saa4P31532 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Saa4P31532 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms