Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pou3f3P31361 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pou3f3P31361 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pou3f3P31361 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms