Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd28P31041 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd28P31041 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms