Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc6a9P28571 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a9P28571 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms