Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col2a1P28481 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col2a1P28481 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col2a1P28481 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms