Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lef1P27782 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lef1P27782 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms