Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PdgfraP26618 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PdgfraP26618 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PdgfraP26618 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms