Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
U2af2P26369 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2af2P26369 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2af2P26369 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms