Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd247P24161 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd247P24161 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd247P24161 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd247P24161 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms