Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Myo5bP21271 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Myo5bP21271 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Myo5bP21271 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms