Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prim1P20664 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prim1P20664 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prim1P20664 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prim1P20664 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prim1P20664 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms