Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ntf3P20181 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ntf3P20181 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms