Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rps6ka1P18653 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rps6ka1P18653 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms