Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P18530 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
P18530 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P18530 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P18530 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P18530 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P18530 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P18530 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P18530 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P18530 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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