Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P18528 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P18528 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P18528 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P18528 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P18528 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P18528 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P18528 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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