Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb1P17919 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hoxb1P17919 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hoxb1P17919 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hoxb1P17919 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hoxb1P17919 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hoxb1P17919 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms