Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ptbp1P17225 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptbp1P17225 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms