Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atf2P16951 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Atf2P16951 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atf2P16951 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms