Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp53P15975 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp53P15975 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp53P15975 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp53P15975 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms