Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme1P15532 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nme1P15532 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms