Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Lmnb1P14733 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lmnb1P14733 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lmnb1P14733 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms