Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Itga5P11688 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Itga5P11688 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga5P11688 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Itga5P11688 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itga5P11688 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms