Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd1d1P11609 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd1d1P11609 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms